Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pagr1aQ99L02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pagr1aQ99L02 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1aQ99L02 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms