Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prpf19Q99KP6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms