Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lims1Q99JW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lims1Q99JW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms