Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clstn3Q99JH7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clstn3Q99JH7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms