Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pacsin3Q99JB8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pacsin3Q99JB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pacsin3Q99JB8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms