Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apobec3Q99J72 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apobec3Q99J72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apobec3Q99J72 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms