Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Slc8b1Q925Q3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc8b1Q925Q3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms