Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sfxn4Q925N1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sfxn4Q925N1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms