Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prss28Q924N9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss28Q924N9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss28Q924N9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms