Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Clip1Q922J3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Clip1Q922J3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Clip1Q922J3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Clip1Q922J3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms