Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Odf3Q920N1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Odf3Q920N1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Odf3Q920N1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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