Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Med28Q920D3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med28Q920D3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms