Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca5Q91ZW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarca5Q91ZW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarca5Q91ZW3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms