Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx18Q91ZR2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx18Q91ZR2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms