Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf6Q91YR7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf6Q91YR7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf6Q91YR7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms