Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Synpo2Q91YE8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Synpo2Q91YE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Synpo2Q91YE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms