Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pcdhga12Q91XY7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pcdhga12Q91XY7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms