Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmco4Q91WU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco4Q91WU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmco4Q91WU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms