Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Klc3Q91W40 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Klc3Q91W40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Klc3Q91W40 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms