Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tdrd3Q91W18 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tdrd3Q91W18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tdrd3Q91W18 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms