Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt79Q8VED5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt79Q8VED5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms