Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sft2d2Q8VD57 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sft2d2Q8VD57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sft2d2Q8VD57 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms