Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt25Q8VCW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt25Q8VCW2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms