Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp3Q8R4B8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrp3Q8R4B8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrp3Q8R4B8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms