Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slf1Q8R3P9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slf1Q8R3P9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slf1Q8R3P9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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