Protein–RNA interactions for Protein: Q8R395

Commd5, COMM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd5Q8R395 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Commd5Q8R395 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Commd5Q8R395 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms