Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf3c5Q8R2T8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gtf3c5Q8R2T8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c5Q8R2T8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms