Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f4Q8R0K9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2f4Q8R0K9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f4Q8R0K9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms