Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hecw1Q8K4P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Hecw1Q8K4P8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Hecw1Q8K4P8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Hecw1Q8K4P8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms