Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rdh16f2Q8K3M1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rdh16f2Q8K3M1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms