Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
OptnQ8K3K8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OptnQ8K3K8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OptnQ8K3K8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms