Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyripQ8K3I4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyripQ8K3I4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyripQ8K3I4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms