Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lrrtm1Q8K377 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lrrtm1Q8K377 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms