Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Txndc11Q8K2W3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Txndc11Q8K2W3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Txndc11Q8K2W3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms