Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SrrdQ8K2M3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SrrdQ8K2M3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms