Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Glis1Q8K1M4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Glis1Q8K1M4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms