Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh3Q8K1E6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh3Q8K1E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alkbh3Q8K1E6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms