Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34c1Q8K193 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Cldn34c1Q8K193 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn34c1Q8K193 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Cldn34c1Q8K193 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Cldn34c1Q8K193 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cldn34c1Q8K193 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34c1Q8K193 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34c1Q8K193 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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