Protein–RNA interactions for Protein: Q8K174

Tmem60, Transmembrane protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem60Q8K174 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem60Q8K174 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmem60Q8K174 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms