Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkn3Q8K045 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkn3Q8K045 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkn3Q8K045 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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