Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF8

Ago4, Protein argonaute-4, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago4Q8CJF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ago4Q8CJF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ago4Q8CJF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ago4Q8CJF8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms