Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syne4Q8CII8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syne4Q8CII8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Syne4Q8CII8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms