Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cog3Q8CI04 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cog3Q8CI04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cog3Q8CI04 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms