Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpc3Q8CFZ4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpc3Q8CFZ4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms