Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brf1Q8CFK2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brf1Q8CFK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brf1Q8CFK2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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