Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf17Q8CFA7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klf17Q8CFA7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klf17Q8CFA7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms