Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup88Q8CEC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup88Q8CEC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms