Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc178Q8CDV0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc178Q8CDV0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms