Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc73Q8CDM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc73Q8CDM4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc73Q8CDM4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms