Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ufl1Q8CCJ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ufl1Q8CCJ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms